1948年底至1949年初,南京国民党政府从南迁到南京的文物中挑选出2972箱文物运往台湾,后于台北市建立新馆,公开对外展出。余下的大批文物,在1949年以后陆续运回故宫博物院一万余箱,但至今还有2221箱仍封存于南京库房。